Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms