Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt10P02535 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt10P02535 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt10P02535 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt10P02535 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms