Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Serf1O88892 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Serf1O88892 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Serf1O88892 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms