Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlkO54988 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlkO54988 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlkO54988 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlkO54988 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlkO54988 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlkO54988 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms