Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf12O35738 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms