Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms