Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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