Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms