Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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