Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP36Q9P275 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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