Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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