Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms