Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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