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| FHL3 | Q13643 | CLDND1-208 | ENST00000503004 | 2818 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF850-202 | ENST00000591344 | 7714 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC109780.1-201 | ENST00000451768 | 1344 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | GPR1-201 | ENST00000407325 | 2295 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC004817.4-201 | ENST00000602396 | 3625 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | CDH9-201 | ENST00000231021 | 3079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | VWC2L-201 | ENST00000312504 | 4610 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC072052.1-201 | ENST00000496556 | 306 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | CHMP1B2P-202 | ENST00000614414 | 6813 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | SASS6-201 | ENST00000287482 | 3880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AFF2-201 | ENST00000286437 | 12280 nt | TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | STXBP4-202 | ENST00000398391 | 2160 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | CHST9-203 | ENST00000618847 | 11388 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC239868.2-201 | ENST00000564237 | 4527 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | KCNJ10-205 | ENST00000638728 | 4351 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | DGKB-203 | ENST00000403951 | 6917 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | RAPGEF4-213 | ENST00000535187 | 3707 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF83-203 | ENST00000541777 | 3743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | SV2B-201 | ENST00000330276 | 11202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | OR2L13-202 | ENST00000641714 | 1948 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF788-203 | ENST00000430298 | 3941 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC02393-202 | ENST00000614177 | 1993 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | OR9Q2-202 | ENST00000641291 | 3774 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | SERPINI2-209 | ENST00000616363 | 1769 nt | TSL 5 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | MAP3K7-203 | ENST00000369327 | 4558 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.41-201 | ENST00000362646 | 102 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SKP145-201 | ENST00000363291 | 303 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | OR5V1-215 | ENST00000377154 | 1266 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | MEIG1-201 | ENST00000378240 | 507 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.493-201 | ENST00000384422 | 102 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |