Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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