Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms