Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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