Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SGCGQ13326 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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SGCGQ13326 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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SGCGQ13326 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SGCGQ13326 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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