Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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