Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms