Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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COPS7AQ9UBW8 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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COPS7AQ9UBW8 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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COPS7AQ9UBW8 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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COPS7AQ9UBW8 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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