Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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