Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TAF1AQ15573 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms