Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP140Q13342 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP140Q13342 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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