Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms