Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.3 ms