Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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