Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF1Q12946 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms