Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CXCL3P19876 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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CXCL3P19876 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CXCL3P19876 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CXCL3P19876 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CXCL3P19876 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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