Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms