Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP44Q9C0F1 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms