Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms