Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms