Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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