Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms