Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms