Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms