Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms