Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NCF4Q15080 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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NCF4Q15080 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NCF4Q15080 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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NCF4Q15080 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCF4Q15080 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCF4Q15080 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCF4Q15080 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCF4Q15080 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCF4Q15080 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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