Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms