Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGB3BPQ13352 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms