Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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