Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CHAF1BQ13112 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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