Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPN13Q12923 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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