Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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