Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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SH3BP1Q9Y3L3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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