Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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UBXN4Q92575 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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UBXN4Q92575 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
UBXN4Q92575 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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