Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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