Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms