Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms